المركز يعتبر من أهم المراكز التأهيلية في منطقة مكة المكرمة ويقدم دورا رئيسيا وبارزا في خدمة عدد كبير من المراجعين الذين يتم  تحويلهم ليس فقط من مستشفيات محافظة جدة ولكن يشمل أيضا المحولين من مستشفيات مناطق المملكة.

الأقسام الرئيسية :
قسم العلاج الطبيعي ويتضمن منطقة علاج للرجال تتكون من أربع غرف علاجية تحتوي كل غرفة على سريرين علاجية خاصة  وسرير لجهاز الشد للفقرات القطنية والعنقية وكذلك صالة للتمارين العلاجية وهذه منطقة مجهزة بكل الأجهزة الضرورية لأداء البرامج  العلاجية.
كما يتضمن قسم العلاج الطبيعي منطقة العلاج المائي وتحتوي على احدث الأجهزة للعلاج المائي بأنواعه المختلفة ومنطقة حوض السباحة وتحتوي على بركة بمواصفات قياسية وفتحتان لضخ الماء المضغوط للإغراض العلاجية ومتصلة بشبكة لتعقيم وتنقية المياه  المستخدمة.
كما يوجد في القسم منطقة لعلاج النساء وهذه المنطقة مقسمة لمناطق علاجية وصممت لتكون مثيلة لمنطقة علاج الرجال بكل تفاصيلها  مع مراعاة الفصل التام بين تلك المنطقتين.

خدمات العلاج الطبيعي :
-العلاج بالتمارين حيث يتم وصف وتطبيق برنامج خاص بكل حالة حسب نوع الإصابة وموقعها واحتياج المريض .
-العلاج الكهربائي وتستخدم في هذا النوع احدث الأجهزة الخاصة بالعلاج الطبيعي مثل أجهزة الموجات القصيرة وأجهزة الموجات  فوق الصوتية وأجهزة الأشعة فوق الحمراء والأشعة فوق البنفسجية وأجهزة شد الفقرات العنقية والظهرية وأجهزة التنبيه الكهربائي  بأنواعها المتعددة.
-العلاج المائي من المميزات التي يتميز بها قسم العلاج الطبيعي بمستشفى الملك عبدالعزيز ومركز الأورام حيث توجد بركة مائية بمقاسات يتم فيها إعطاء المريض التمارين المائية بموافقة الأخصائي المعالج له بغرض الحصول على أفضل النتائج العلاجية  الموجودة. كما توجد أحواض مائية متعددة المقاسات والاستخدامات فمنها ما هو خاص للأطراف العلوية أو الأطراف السفلية أو كامل الجسم كما  يدخل ضمن هذا النوع المائي الكمادات سواء الحارة او الباردة منها وأيضا الحمام الشمعي حيث يستخدم الشمع المذاب مع زيت البرافين  لعلاج بعض الحالات.

قسم الطب الطبيعي
ويعمل بهذا القسم حاليا 7 أطباء يقومون بتقديم خدمة استقبال المراجعين المحولين للمركز حيث يتم الكشف عليهم مرة أخرى لتأكيد التشخيص المبدئي ومن ثم تحويلهم إلى الأقسام الأخرى.

وحدة أمراض التخاطب
و تضم أخصائي التخاطب اللغوي ويعمل في هذا القسم أخصائي لتقييم الحالات المتنوعة من أمراض التخاطب اللغوي مثل أمراض  التأخر اللغوي وحالات التأتأة والحبسة الكلامية وأمراض الصوت. ويتولى أخصائي التخاطب النفسي معالجة حالات أمراض التخاطب ذات المنشأ النفسي والتي يكون للعامل النفسي فيها الدور الأكبر  ويستخدم في علاجها أساليب خاصة بأمراض التخاطب مثل لغة الإشارة والاختبارات غير اللغوية والتي تتناسب مع طبيعة حالات
مرضى التخاطب النفسي.

قسم الأطراف التعويضية والصناعية
الذي يتولى صناعة وتركيب الأطراف الصناعية والأجهزة المساندة حيث يقوم أخصائيون مؤهلون جيدا في هذا القسم باستقبال  المريض والذي تقرر له عمل إما جهاز حماية أو تعديل وهذا النوع من الأجهزة يؤدي غرضين رئيسيين الأول حماية بحيث انه يمنع  حدوث تشوهات أو انحناءات في الأطراف أو العمود الفقري نتيجة لمرض ما أو إصابة او لمنع زيادة التشوهات او الانحناءات إذا  كانت أصلا موجودة والثاني التعديل ويختص هذا النوع من الأجهزة بمحاولة تقويم وتعديل تشوهات تكون عادة خلقية مثل انحناءات  العمود الفقري الجانبية.
كما يقوم هذا القسم بإنتاج الأجهزة التعويضية التي تعمل عمل عضو فقده المريض لأي سبب من الأسباب حيث يتم اخذ المقاسات المناسبة له ثم يتم صناعة الطر في مراحل مختلفة ومن ثم يتم تدريب المريض في سبيل استفادة المريض من الأجهزة التعويضية الموصوفة له. ويعتبر قسم الأطراف الصناعية والأجهزة التعويضية في مستشفى الملك عبدالعزيز ومركز الأورام من الأقسام العالية التجهيز وتقدم خدماته للمرضى المراجعين للمستشفى من مختلف المناطق.

قسم التأهيل المهني
الذي يعتبر خطوة متقدمة في العملية التأهيلية وهي الخطوة الأخيرة وما قبل عودة المريض لممارسة حياته الطبيعية حيث يتم تأهيل المريض مهنيا لاستعادة القدرة على أداء مهارات خاصة تعتمد على التوافق العضلي العصبي.

قسم الخدمة الاجتماعية
الذي يتولى بحث المشكلات الاجتماعية والنفسية والمادية للمرضى والعمل على إيجاد الحلول المناسبة لها كما يقوم بالتنسيق مع الإدارة والقيام بالاتصالات الضرورية مع الجهات الخارجية كالمؤسسات الاجتماعية وجمع البيانات عن المريض لاستكمال البيانات الخاصة  بالمريض وتسهيل عملية خروجه.